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河南中医药大学基础医学院前身为中医系，始建于1958年，2002年7月更名为基础医学院。基础医学院作为河南中医药大学较大的教学单位，承担着学校各专业、各层次中、西医基础课及专业课等100余门课程的理论教学和30余门课程实验教学任务。开设有预防医学、中西医临床医学、中医学(仲景学术传承实验班)本科专业，现有在校生 798人。
基础医学院现有教职工162名，其中教授16名、副教授(高级实验师)45名;博士62名、硕士78名。有省管优秀专家1名，省特聘教授1名，省级教学名师1名，校级特聘教授1名，省教育厅学术技术带头人14名，先后有校级教学名师8名，博士研究生导师11名，硕士研究生导师56名。
现有学科、教研室19个，其中国家局级重点学科5个，省重点学科一级学科1个，省重点学科二级学科9个，校级重点学科1个。省级精品课程6门，校级精品课程15门。省级精品资源共享课6门，省级视频公开课1门，省级双语教学示范课程3门。省级优秀教学团队3个，市级科研创新团队2个;校级优秀教学团队15个，科研创新团队3个。省级医学实验教学示范中心1个，基础医学院科研实验中心1个。
设有5个博士学位授权二级学科：中医基础理论、中医诊断学、方剂学、中医临床基础、中医医史文献;10个硕士学位授权二级学科：中医基础理论、方剂学、中医临床基础、中医诊断学、中西医结合基础、中医医史文献、病理学与病理生理学、医事管理、病原生物学、人体解剖与组织胚胎学。在读研究生一百余人。
近年来，基础医学院人才培养取得显著成绩，在本科生、研究生的科技创新学习和课外学术科技作品创作方面荣获多项国家级、省部级奖项;还获得多项国家、省、市、校级先进集体和个人荣誉;毕业生广泛受到用人单位与社会各界的好评，就业率在保持高水平的基础上逐年攀升。
